Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF7

LOC100131303, HCG1775037, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOC100131303A0A0U1RQF7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOC100131303A0A0U1RQF7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms