Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AC012313.8-201ENST00000595059 5402 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 PKN2-203ENST00000370521 6121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 MAST4-202ENST00000403625 10711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 PCDHGB4-202ENST00000615384 4725 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 CDK16-204ENST00000457458 3158 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 PAAF1-214ENST00000544552 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AC009779.3-202ENST00000550412 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 TRUB2-201ENST00000372890 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 EDNRA-202ENST00000358556 3823 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 GPR179-204ENST00000621958 7983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 DPY19L3-201ENST00000342179 6015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 ZNF423-204ENST00000562520 4018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 RIMS2-207ENST00000504942 4228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AP4S1-201ENST00000216366 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 PAFAH2-202ENST00000374284 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 CTAGE6-201ENST00000470691 2608 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 RASGRP4-215ENST00000614135 2942 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 TMCO4-201ENST00000294543 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 SV2C-201ENST00000322285 3010 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 CFAP69-213ENST00000497910 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 CASP8AP2-205ENST00000551025 6151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 PPARGC1B-204ENST00000403750 3146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 BHLHE40-201ENST00000256495 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 NPHS1-201ENST00000353632 3741 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 ST6GALNAC5-202ENST00000477717 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 ANKRD26P1-201ENST00000566201 3921 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 ZNF391-201ENST00000244576 4079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 PRKAR1A-217ENST00000589228 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 GAA-201ENST00000302262 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 MOB4-202ENST00000323303 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 THRAP3-201ENST00000354618 4432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 STRIP1-201ENST00000369795 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 ZC4H2-202ENST00000374839 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 UGGT2-203ENST00000376747 4832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 ITSN1-201ENST00000379960 3026 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 THOC5-204ENST00000397873 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 STMN1-206ENST00000455785 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 SEMA4G-205ENST00000517724 2675 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AP4S1-205ENST00000554345 1491 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AL445471.2-201ENST00000568143 2443 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 CHRNB1-208ENST00000576360 1837 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 MPP4-212ENST00000620095 2364 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 RAB5B-211ENST00000628569 496 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 OR4D2-202ENST00000641866 2011 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 RGS7BP-201ENST00000334025 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 ARHGAP30-202ENST00000368015 3887 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 SGSM1-201ENST00000400358 6643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 TWNK-202ENST00000370228 3175 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 CLU-201ENST00000316403 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 CCDC87-201ENST00000333861 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 ATP8B3-203ENST00000526092 2759 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AC100868.1-201ENST00000262283 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 CYP3A4-202ENST00000354593 2342 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 TACC1-201ENST00000276520 6513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AC046185.1-201ENST00000580553 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 WARS2-IT1-201ENST00000423984 2060 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AC009078.3-201ENST00000624205 4084 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 OR13A1-202ENST00000536058 2023 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 TOP1MT-213ENST00000521193 1960 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 CACNA1C-209ENST00000399603 7377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 TTYH2-201ENST00000269346 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 MYO15A-203ENST00000418233 3411 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 CDKL2-202ENST00000429927 3383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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