Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 PPP1R32-203ENST00000432063 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AC126564.1-201ENST00000623628 2013 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 GPC3-201ENST00000370818 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 SLC7A1-201ENST00000380752 7347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 ZNF831-203ENST00000637017 10953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 DEFA8P-201ENST00000457582 285 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AC079336.3-201ENST00000577227 475 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 ADAM8-202ENST00000445355 3279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 TNIP1-218ENST00000523338 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 TBC1D3I-201ENST00000616671 1982 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 HJURP-204ENST00000432087 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 TRO-201ENST00000173898 4647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 CD27-AS1-209ENST00000545339 1766 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 MBP-207ENST00000397865 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 C6orf163-203ENST00000608326 2110 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 PHF21B-202ENST00000396103 3540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 SERINC5-202ENST00000507668 6479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 C1orf198-203ENST00000470540 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 SNAP25-202ENST00000304886 2050 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 PAX6-201ENST00000241001 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 GPALPP1-202ENST00000361121 3410 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 SLC4A9-201ENST00000432095 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 SNX1-211ENST00000560829 1869 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 CYP1A2-201ENST00000343932 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 ZFAT-202ENST00000429442 4421 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 GSDMB-201ENST00000309481 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 GLT6D1-201ENST00000371763 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 FAM117A-209ENST00000513602 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 GLT6D1-202ENST00000613244 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 PALLD-209ENST00000507735 4379 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 WASHC5-201ENST00000318410 4187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 POLR1B-216ENST00000537335 4961 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 GPR161-208ENST00000537209 8256 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 TUBGCP4-208ENST00000564079 6798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 HSH2D-206ENST00000613986 1957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 KRT8P5-201ENST00000592443 1458 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 TACC1-201ENST00000276520 6513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 CNGB1-202ENST00000311183 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 WWC2-209ENST00000513834 4887 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 REPS1-205ENST00000415951 2424 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 ZNF142-205ENST00000449707 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 SMARCB1-203ENST00000407082 1182 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 UBTFL5-201ENST00000443682 1191 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 AL161668.2-201ENST00000531638 492 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 NPIPP1-202ENST00000534799 1214 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 LAMB3-202ENST00000367030 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 PITPNB-201ENST00000320996 2826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 C1S-221ENST00000617865 2844 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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