Protein–RNA interactions for Protein: P56282

POLE2, DNA polymerase epsilon subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE2P56282 AP001046.1-201ENST00000435702 2816 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLE2P56282 AC020741.1-201ENST00000381217 2079 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLE2P56282 ABLIM3-203ENST00000356541 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLE2P56282 ABLIM3-211ENST00000517451 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLE2P56282 INTS6L-206ENST00000639893 3904 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLE2P56282 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLE2P56282 EBF2-203ENST00000520164 5145 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLE2P56282 BIVM-201ENST00000257336 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLE2P56282 PPP4R1-202ENST00000400555 3885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLE2P56282 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 HMGB1-206ENST00000405805 4199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 SEC14L1-204ENST00000436233 5295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 DOCK4-204ENST00000428084 7997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 AMPD2-203ENST00000358729 2838 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 C9orf3-203ENST00000375315 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 PRRX1-207ENST00000497230 3501 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 NFATC1-202ENST00000318065 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 PRRG4-201ENST00000257836 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 CD38-201ENST00000226279 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 HERC6-203ENST00000380265 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 AC080013.1-204ENST00000607426 2185 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 CHST15-202ENST00000435907 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 NPC1L1-204ENST00000546276 4826 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 TRIM37-201ENST00000262294 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 RASAL1-203ENST00000446861 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 POTEI-201ENST00000451531 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 SLC44A4-210ENST00000544672 2634 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 MYH3-205ENST00000583535 6037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 LINC01209-201ENST00000451289 2400 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 FNBP4-201ENST00000263773 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 FER1L6-AS1-201ENST00000518567 2315 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 RBFOX1-224ENST00000641259 3651 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 AGPAT1-204ENST00000395496 2103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 DNAJB12-203ENST00000444643 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 NAV2-204ENST00000396087 7882 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 C10orf76-202ENST00000370033 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 CLTC-202ENST00000393043 5292 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 KDM2A-210ENST00000529006 6967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 LINC02202-201ENST00000499583 2664 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 SOCS6-201ENST00000397942 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 CHMP2B-201ENST00000263780 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 CAMKK2-205ENST00000392474 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 PRKAB2-201ENST00000254101 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 AC106865.1-201ENST00000602666 3034 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLE2P56282 HERC2P9-203ENST00000528584 2947 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
POLE2P56282 SUCO-209ENST00000610051 2925 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
POLE2P56282 DAAM2-208ENST00000538976 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
POLE2P56282 AC006033.2-201ENST00000609522 1968 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
POLE2P56282 NAV1-203ENST00000367302 9685 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
POLE2P56282 PITX2-202ENST00000354925 3359 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
POLE2P56282 ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 2500 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
POLE2P56282 CADM3-202ENST00000368125 3745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
POLE2P56282 KLHL30-201ENST00000409223 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
POLE2P56282 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
POLE2P56282 BORA-202ENST00000377815 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
POLE2P56282 MVP-201ENST00000357402 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
POLE2P56282 MATN2-218ENST00000524308 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
POLE2P56282 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
POLE2P56282 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
POLE2P56282 EXOC7-207ENST00000411744 2031 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
POLE2P56282 DFFB-201ENST00000338895 3105 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
POLE2P56282 TRIM21-201ENST00000254436 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
POLE2P56282 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
POLE2P56282 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
POLE2P56282 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
POLE2P56282 DLGAP2-AS1-201ENST00000518009 1810 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
POLE2P56282 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
POLE2P56282 RNF10-201ENST00000325954 3825 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
POLE2P56282 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
POLE2P56282 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
POLE2P56282 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
POLE2P56282 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms