Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 DLEC1-202ENST00000346219 5490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 RAP1GAP-205ENST00000374763 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 SLIT2-212ENST00000622093 6380 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 SDR16C5-203ENST00000522671 1988 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 TBC1D3I-201ENST00000616671 1982 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 MROH1-211ENST00000544576 3673 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 NVL-201ENST00000281701 3123 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AC068580.4-203ENST00000636397 4038 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 MPP4-208ENST00000447335 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 SEMA6D-201ENST00000316364 6099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 ADGRG1-266ENST00000568908 3852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 CCDC144CP-201ENST00000340196 2823 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 CNTNAP2-207ENST00000628930 1944 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 DDA1-201ENST00000359866 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 FUT10-211ENST00000524021 2042 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AC012313.5-201ENST00000594816 2517 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 CARS-202ENST00000380525 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 WASHC2A-201ENST00000282633 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 DDB2-201ENST00000256996 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 KDM5D-202ENST00000382806 5134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 EIF3C-204ENST00000564243 2870 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 ZNF730-202ENST00000597761 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AC026797.1-201ENST00000624837 2869 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 INS-IGF2-205ENST00000641326 2861 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 SLC5A6-201ENST00000310574 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 CIITA-212ENST00000618207 2844 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 CHTF8-201ENST00000306585 2561 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 DPP9-201ENST00000262960 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 DUSP27-203ENST00000443333 4034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 MIEF1-203ENST00000404569 3797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 PDXK-209ENST00000467908 7194 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 RFC5-201ENST00000392542 2449 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 FN1-212ENST00000446046 7952 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 ZNF319-201ENST00000299237 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 HIRIP3-201ENST00000279392 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 LINC01254-202ENST00000567609 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 PPARD-204ENST00000418635 3453 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 CLINT1-210ENST00000530742 3344 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 ANO3-201ENST00000256737 6642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 PCDHGB4-202ENST00000615384 4725 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 PTPN6-201ENST00000318974 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 FP565260.3-202ENST00000623960 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AC091167.3-201ENST00000561573 3838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 ALDOA-229ENST00000636698 420 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 DDX4-201ENST00000353507 2778 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AC037459.3-201ENST00000521025 2750 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 ATAT1-204ENST00000330083 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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