Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 SCML1-201ENST00000380041 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 VRK3-205ENST00000593919 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 PCGF2-204ENST00000616199 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 ENOSF1-203ENST00000383578 4188 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 TRO-201ENST00000173898 4647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 STT3A-211ENST00000529196 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 SHPRH-201ENST00000275233 6649 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 BDNF-202ENST00000356660 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 BDNF-218ENST00000533246 4000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 DIP2C-205ENST00000634311 4961 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 AC133919.3-201ENST00000621407 1804 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 STXBP1-221ENST00000637953 3925 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 DGKZP1-201ENST00000378718 2776 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 PCDHB11-201ENST00000354757 4198 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 TGM7-201ENST00000452443 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 DNAJB14-205ENST00000442697 6075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 HIF3A-204ENST00000300862 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 EME1-202ENST00000393271 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 MIS18BP1-201ENST00000310806 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 LIFR-AS1-201ENST00000500733 3803 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 THEGL-202ENST00000512175 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 NLRX1-214ENST00000525863 2850 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 TRAPPC2L-211ENST00000565504 3102 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 NPNT-202ENST00000379987 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 FAM102A-202ENST00000373084 3352 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 AC026992.2-203ENST00000563004 2419 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 ERI1-201ENST00000250263 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 FAM198B-207ENST00000592057 3425 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 MSRA-202ENST00000382490 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 LINGO1-AS1-201ENST00000558691 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 LINC00908-202ENST00000578613 2242 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 AC098650.1-201ENST00000635992 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 IQUB-202ENST00000466202 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 CCT8-201ENST00000286788 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 AIMP2-201ENST00000223029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 PRDX1-202ENST00000319248 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 MT1F-201ENST00000334350 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 RPS7-202ENST00000403564 764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 LINC00484-201ENST00000414768 561 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 PRDM2-213ENST00000503842 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 AC022424.2-201ENST00000514848 454 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 DUSP22-211ENST00000604971 3824 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 KCNH1-201ENST00000271751 8172 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 RNF220-202ENST00000355387 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 SERINC4-201ENST00000299969 2318 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 SLC25A25-204ENST00000373069 3376 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 HERC2P3-204ENST00000426501 5995 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 SLC20A2-201ENST00000342228 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 C5orf15-201ENST00000231512 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 AMBRA1-201ENST00000314845 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 PAK5-203ENST00000378429 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 FAM177A1-201ENST00000280987 2927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 NDEL1-203ENST00000402554 1858 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 TBC1D26-201ENST00000437605 1868 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 ARL4A-203ENST00000396663 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 AL157832.2-205ENST00000597245 1649 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 SLC2A9-208ENST00000506583 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 ZFP37-203ENST00000555206 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 PPP4R1-202ENST00000400555 3885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 AXIN1-202ENST00000354866 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 DNAJC11-202ENST00000377577 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 AL359510.2-201ENST00000624958 2249 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 GABPB1-203ENST00000380877 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 KRIT1-201ENST00000340022 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 STARD13-201ENST00000255486 5798 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 STARD13-204ENST00000399365 5784 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 FMO1-203ENST00000402921 2003 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 NMT1-213ENST00000592782 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 KRT8P5-201ENST00000592443 1458 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 POFUT2-213ENST00000612472 2959 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 ZNF140-202ENST00000355557 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 AC099489.1-203ENST00000598234 10568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 AACS-201ENST00000316519 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 CTAGE7P-201ENST00000435712 2436 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 LINC01471-201ENST00000461398 3079 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 211.1 ms