Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 CDC14A-201ENST00000336454 4137 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 FLT4-202ENST00000393347 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 DOCK10-201ENST00000258390 7260 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 RGS3-207ENST00000374140 4591 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 UBXN4-201ENST00000272638 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 ACKR1-202ENST00000368122 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 NAMA-207ENST00000605707 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 ATG10-201ENST00000282185 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 LAMP2-201ENST00000200639 1867 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 PCDHGA7-201ENST00000518325 4605 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 PDHA1-206ENST00000422285 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 TJAP1-202ENST00000372444 2778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 TJAP1-203ENST00000372445 2751 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 PANK2-206ENST00000497424 4815 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 COL12A1-202ENST00000345356 5886 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 RP2-201ENST00000218340 3803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 TRAF3-201ENST00000347662 7700 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 FAM105A-201ENST00000274217 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 KLHL30-201ENST00000409223 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 NAPB-207ENST00000617876 3883 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 PKD1L2-210ENST00000533478 5669 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 KCNA1-201ENST00000382545 7997 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 SERINC5-202ENST00000507668 6479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 PPP1R26P1-201ENST00000474415 3613 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 HOTTIP-203ENST00000521028 3345 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 ARSG-209ENST00000621439 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 AL354861.3-201ENST00000600140 2412 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 RHOH-219ENST00000614836 2114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 HPSE2-201ENST00000370546 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 BORA-202ENST00000377815 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 STMN1-206ENST00000455785 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 ELOVL6-201ENST00000302274 3090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 PCDHGA6-201ENST00000517434 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 CMC2-201ENST00000219400 10301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 SH3BGRL2-201ENST00000369838 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 ARL13B-201ENST00000303097 3264 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 DSP-202ENST00000418664 7812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 SHANK2-201ENST00000338508 7271 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 SMTN-222ENST00000612341 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 AL353593.1-201ENST00000602517 3955 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 NME1-NME2-201ENST00000376392 894 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 AK2-208ENST00000487289 920 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 CYB5D2-202ENST00000573984 495 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 WASHC5-201ENST00000318410 4187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 TTC26-207ENST00000478836 1794 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 HERC6-202ENST00000273960 3473 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 USP14-208ENST00000582707 1803 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 PKP2-202ENST00000340811 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 KCNA4-201ENST00000328224 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 WDR47-203ENST00000369962 4199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 MTRF1L-203ENST00000367233 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 IYD-208ENST00000500320 2158 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 ZKSCAN1-202ENST00000426572 2011 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 GRIP2-205ENST00000621039 7752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 CDX2-201ENST00000381020 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 IL18BP-209ENST00000497194 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 ZFAT-202ENST00000429442 4421 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 AC090136.3-201ENST00000520834 2704 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 DUSP14-205ENST00000614411 2207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 TNS1-220ENST00000611415 6509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 AL109976.1-201ENST00000621919 5678 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 LINC01993-201ENST00000374945 2934 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 MSH6-213ENST00000614496 4150 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 AC244154.1-201ENST00000620148 1555 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 TMEM134-201ENST00000308022 3534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms