Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 LIF-201ENST00000249075 3969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 CR2-201ENST00000367057 4240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 BEND3P2-201ENST00000414425 2254 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 FAM153B-211ENST00000510151 1641 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 FAM153A-216ENST00000510276 1641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 PMEL-218ENST00000552882 2516 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 TRIM23-203ENST00000381018 1855 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 SH3RF2-201ENST00000359120 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 FAM49B-215ENST00000519824 3798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 KCNA10-201ENST00000369771 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 USP20-202ENST00000358355 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 MYRF-201ENST00000265460 5745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 MAN2C1-224ENST00000565683 3300 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 GRID1-201ENST00000327946 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 SGSM2-211ENST00000574563 3410 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 MEI1-201ENST00000401548 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 ZNF423-207ENST00000567169 4017 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 QSOX1-202ENST00000367602 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 LILRB2-203ENST00000391748 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 METTL3-201ENST00000298717 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 ABHD17B-201ENST00000333421 2614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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LSAMPQ13449 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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LSAMPQ13449 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 AC022424.2-201ENST00000514848 454 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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LSAMPQ13449 RBM8A-204ENST00000583313 4961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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LSAMPQ13449 FAM155A-201ENST00000375915 8503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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LSAMPQ13449 SLIT2-204ENST00000504154 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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LSAMPQ13449 CDC14A-201ENST00000336454 4137 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 TCHP-202ENST00000405876 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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LSAMPQ13449 PPFIA4-201ENST00000272198 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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LSAMPQ13449 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 ITGB1BP1-201ENST00000238091 1772 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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LSAMPQ13449 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 LIMK1-201ENST00000336180 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 DTL-201ENST00000366991 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 AC091807.1-201ENST00000418838 1544 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 POLR3F-201ENST00000377603 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 EPM2A-217ENST00000639423 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 AK7-201ENST00000267584 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 CHMP1B-201ENST00000526991 3054 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 FAM177A1-203ENST00000396472 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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