Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 LUCAT1-201ENST00000511918 828 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SCN2BO60939 AIPL1-210ENST00000576307 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SCN2BO60939 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SCN2BO60939 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SCN2BO60939 AC100788.1-201ENST00000591108 945 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SCN2BO60939 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SCN2BO60939 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SCN2BO60939 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SCN2BO60939 AL592295.4-201ENST00000636161 997 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SCN2BO60939 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SCN2BO60939 USP11-204ENST00000377107 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SCN2BO60939 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SCN2BO60939 ZNF33A-205ENST00000469037 1530 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SCN2BO60939 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SCN2BO60939 SLC6A6-204ENST00000613060 6526 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SCN2BO60939 DCAF16-201ENST00000382247 4548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SCN2BO60939 LINC00540-203ENST00000631321 2412 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SCN2BO60939 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SCN2BO60939 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SCN2BO60939 LINC01471-201ENST00000461398 3079 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SCN2BO60939 POC1B-GALNT4-202ENST00000548729 5436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SCN2BO60939 CTCFL-211ENST00000502686 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SCN2BO60939 PLOD3-201ENST00000223127 2920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SCN2BO60939 SNX1-211ENST00000560829 1869 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SCN2BO60939 FILIP1L-203ENST00000383694 3280 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
SCN2BO60939 PPP1R32-203ENST00000432063 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
SCN2BO60939 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
SCN2BO60939 MAP1S-202ENST00000544059 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SCN2BO60939 AC009108.4-201ENST00000623284 2451 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SCN2BO60939 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SCN2BO60939 CEACAM20-203ENST00000614924 1809 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SCN2BO60939 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SCN2BO60939 PCSK7-215ENST00000540028 3332 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SCN2BO60939 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SCN2BO60939 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SCN2BO60939 SP7-202ENST00000536324 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SCN2BO60939 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SCN2BO60939 TSNAXIP1-201ENST00000388833 2429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SCN2BO60939 AC007389.3-201ENST00000420724 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SCN2BO60939 VDR-202ENST00000395324 4762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SCN2BO60939 CD33-201ENST00000262262 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SCN2BO60939 SLC5A11-205ENST00000545376 2294 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SCN2BO60939 LILRA2-204ENST00000391738 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SCN2BO60939 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SCN2BO60939 FN1-201ENST00000323926 8708 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SCN2BO60939 CCDC138-201ENST00000295124 2383 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SCN2BO60939 CTPS1-202ENST00000372621 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SCN2BO60939 CU639417.6-202ENST00000624872 3241 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SCN2BO60939 C16orf78-201ENST00000299191 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SCN2BO60939 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SCN2BO60939 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
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SCN2BO60939 AC092656.1-202ENST00000515843 998 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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SCN2BO60939 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SCN2BO60939 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SCN2BO60939 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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SCN2BO60939 GRAPL-204ENST00000577213 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SCN2BO60939 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SCN2BO60939 SLC26A6-203ENST00000358747 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SCN2BO60939 YY2-201ENST00000429584 2741 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SCN2BO60939 PCGF2-204ENST00000616199 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SCN2BO60939 PITPNB-201ENST00000320996 2826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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SCN2BO60939 AL132642.2-201ENST00000623423 1998 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
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SCN2BO60939 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SCN2BO60939 PHF21B-203ENST00000403565 3586 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SCN2BO60939 IRF5-208ENST00000473745 2282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SCN2BO60939 TMUB2-214ENST00000590235 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SCN2BO60939 IP6K1-202ENST00000395238 4117 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SCN2BO60939 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SCN2BO60939 TEX35-203ENST00000367641 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SCN2BO60939 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SCN2BO60939 OR13A1-202ENST00000536058 2023 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SCN2BO60939 SPO11-201ENST00000345868 1666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SCN2BO60939 ESR2-213ENST00000557772 5458 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SCN2BO60939 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SCN2BO60939 VAMP7-201ENST00000262640 2496 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SCN2BO60939 CEACAM20-206ENST00000621342 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SCN2BO60939 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SCN2BO60939 JDP2-203ENST00000435893 5401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SCN2BO60939 PCDHGA12-201ENST00000252085 4747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SCN2BO60939 LRRC8E-201ENST00000306708 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SCN2BO60939 FOSB-204ENST00000585836 3550 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SCN2BO60939 FBN3-201ENST00000270509 9232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SCN2BO60939 SUOX-203ENST00000394109 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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