Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAD5-AS1Q9Y6J3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAD5-AS1Q9Y6J3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAD5-AS1Q9Y6J3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms