Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y315

DERA, Deoxyribose-phosphate aldolase, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DERAQ9Y315 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DERAQ9Y315 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DERAQ9Y315 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DERAQ9Y315 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DERAQ9Y315 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DERAQ9Y315 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DERAQ9Y315 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DERAQ9Y315 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DERAQ9Y315 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DERAQ9Y315 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DERAQ9Y315 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DERAQ9Y315 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DERAQ9Y315 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DERAQ9Y315 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DERAQ9Y315 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DERAQ9Y315 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DERAQ9Y315 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DERAQ9Y315 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms