Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNFSF13BQ9Y275 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFSF13BQ9Y275 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFSF13BQ9Y275 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFSF13BQ9Y275 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFSF13BQ9Y275 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFSF13BQ9Y275 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFSF13BQ9Y275 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFSF13BQ9Y275 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFSF13BQ9Y275 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFSF13BQ9Y275 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFSF13BQ9Y275 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFSF13BQ9Y275 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFSF13BQ9Y275 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFSF13BQ9Y275 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFSF13BQ9Y275 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFSF13BQ9Y275 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFSF13BQ9Y275 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFSF13BQ9Y275 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFSF13BQ9Y275 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFSF13BQ9Y275 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFSF13BQ9Y275 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFSF13BQ9Y275 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFSF13BQ9Y275 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFSF13BQ9Y275 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms