Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ90

SPG7, Paraplegin, humanhuman

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Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG7Q9UQ90 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPG7Q9UQ90 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPG7Q9UQ90 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPG7Q9UQ90 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPG7Q9UQ90 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SPG7Q9UQ90 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPG7Q9UQ90 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPG7Q9UQ90 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPG7Q9UQ90 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPG7Q9UQ90 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPG7Q9UQ90 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SPG7Q9UQ90 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SPG7Q9UQ90 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPG7Q9UQ90 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPG7Q9UQ90 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPG7Q9UQ90 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPG7Q9UQ90 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPG7Q9UQ90 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SPG7Q9UQ90 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SPG7Q9UQ90 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SPG7Q9UQ90 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPG7Q9UQ90 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SPG7Q9UQ90 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPG7Q9UQ90 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SPG7Q9UQ90 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SPG7Q9UQ90 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SPG7Q9UQ90 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SPG7Q9UQ90 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SPG7Q9UQ90 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SPG7Q9UQ90 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SPG7Q9UQ90 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SPG7Q9UQ90 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SPG7Q9UQ90 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SPG7Q9UQ90 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SPG7Q9UQ90 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SPG7Q9UQ90 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SPG7Q9UQ90 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SPG7Q9UQ90 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SPG7Q9UQ90 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
SPG7Q9UQ90 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SPG7Q9UQ90 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SPG7Q9UQ90 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
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