Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
DENND2AQ9ULE3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms