Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG4

SLC13A4, Solute carrier family 13 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A4Q9UKG4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC13A4Q9UKG4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC13A4Q9UKG4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC13A4Q9UKG4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC13A4Q9UKG4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC13A4Q9UKG4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC13A4Q9UKG4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC13A4Q9UKG4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC13A4Q9UKG4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC13A4Q9UKG4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC13A4Q9UKG4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC13A4Q9UKG4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC13A4Q9UKG4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC13A4Q9UKG4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC13A4Q9UKG4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC13A4Q9UKG4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC13A4Q9UKG4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC13A4Q9UKG4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC13A4Q9UKG4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC13A4Q9UKG4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC13A4Q9UKG4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC13A4Q9UKG4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC13A4Q9UKG4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC13A4Q9UKG4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC13A4Q9UKG4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC13A4Q9UKG4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC13A4Q9UKG4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC13A4Q9UKG4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC13A4Q9UKG4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC13A4Q9UKG4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC13A4Q9UKG4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC13A4Q9UKG4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC13A4Q9UKG4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC13A4Q9UKG4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC13A4Q9UKG4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC13A4Q9UKG4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC13A4Q9UKG4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC13A4Q9UKG4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC13A4Q9UKG4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC13A4Q9UKG4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC13A4Q9UKG4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SLC13A4Q9UKG4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms