Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ68

MSRA, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRAQ9UJ68 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MSRAQ9UJ68 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MSRAQ9UJ68 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MSRAQ9UJ68 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSRAQ9UJ68 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSRAQ9UJ68 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSRAQ9UJ68 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSRAQ9UJ68 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSRAQ9UJ68 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSRAQ9UJ68 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSRAQ9UJ68 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSRAQ9UJ68 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSRAQ9UJ68 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MSRAQ9UJ68 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MSRAQ9UJ68 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSRAQ9UJ68 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MSRAQ9UJ68 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MSRAQ9UJ68 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MSRAQ9UJ68 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms