Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHM6

OPN4, Melanopsin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN4Q9UHM6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OPN4Q9UHM6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms