Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH73

EBF1, Transcription factor COE1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF1Q9UH73 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms