Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNA9Q9UGM1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms