Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCF2Q9UG63 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCF2Q9UG63 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms