Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPARGC1AQ9UBK2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPARGC1AQ9UBK2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms