Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B2

PTGFRN, Prostaglandin F2 receptor negative regulator, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRNQ9P2B2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PTGFRNQ9P2B2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTGFRNQ9P2B2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTGFRNQ9P2B2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTGFRNQ9P2B2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTGFRNQ9P2B2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTGFRNQ9P2B2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTGFRNQ9P2B2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTGFRNQ9P2B2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTGFRNQ9P2B2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PTGFRNQ9P2B2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTGFRNQ9P2B2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTGFRNQ9P2B2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTGFRNQ9P2B2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTGFRNQ9P2B2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTGFRNQ9P2B2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTGFRNQ9P2B2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTGFRNQ9P2B2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTGFRNQ9P2B2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTGFRNQ9P2B2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTGFRNQ9P2B2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTGFRNQ9P2B2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTGFRNQ9P2B2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTGFRNQ9P2B2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTGFRNQ9P2B2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTGFRNQ9P2B2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTGFRNQ9P2B2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTGFRNQ9P2B2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTGFRNQ9P2B2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTGFRNQ9P2B2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTGFRNQ9P2B2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTGFRNQ9P2B2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTGFRNQ9P2B2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTGFRNQ9P2B2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTGFRNQ9P2B2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms