Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM5

NOP53, Ribosome biogenesis protein NOP53, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP53Q9NZM5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NOP53Q9NZM5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NOP53Q9NZM5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms