Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RDH8Q9NYR8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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