Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUJ3

TCP11L1, T-complex protein 11-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP11L1Q9NUJ3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCP11L1Q9NUJ3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TCP11L1Q9NUJ3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms