Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ATG3Q9NT62 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATG3Q9NT62 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATG3Q9NT62 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATG3Q9NT62 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATG3Q9NT62 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ATG3Q9NT62 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATG3Q9NT62 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATG3Q9NT62 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATG3Q9NT62 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATG3Q9NT62 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATG3Q9NT62 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATG3Q9NT62 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATG3Q9NT62 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATG3Q9NT62 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATG3Q9NT62 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATG3Q9NT62 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATG3Q9NT62 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ATG3Q9NT62 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATG3Q9NT62 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ATG3Q9NT62 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATG3Q9NT62 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATG3Q9NT62 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATG3Q9NT62 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATG3Q9NT62 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATG3Q9NT62 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATG3Q9NT62 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATG3Q9NT62 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATG3Q9NT62 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATG3Q9NT62 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATG3Q9NT62 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATG3Q9NT62 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATG3Q9NT62 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATG3Q9NT62 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATG3Q9NT62 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATG3Q9NT62 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATG3Q9NT62 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATG3Q9NT62 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATG3Q9NT62 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATG3Q9NT62 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATG3Q9NT62 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATG3Q9NT62 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATG3Q9NT62 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATG3Q9NT62 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATG3Q9NT62 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATG3Q9NT62 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATG3Q9NT62 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ATG3Q9NT62 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATG3Q9NT62 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATG3Q9NT62 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATG3Q9NT62 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATG3Q9NT62 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATG3Q9NT62 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATG3Q9NT62 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATG3Q9NT62 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATG3Q9NT62 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATG3Q9NT62 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATG3Q9NT62 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATG3Q9NT62 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATG3Q9NT62 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATG3Q9NT62 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATG3Q9NT62 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATG3Q9NT62 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATG3Q9NT62 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATG3Q9NT62 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ATG3Q9NT62 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATG3Q9NT62 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATG3Q9NT62 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATG3Q9NT62 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATG3Q9NT62 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATG3Q9NT62 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms