Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRH2

SNRK, SNF-related serine/threonine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRKQ9NRH2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNRKQ9NRH2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNRKQ9NRH2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNRKQ9NRH2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNRKQ9NRH2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNRKQ9NRH2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNRKQ9NRH2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNRKQ9NRH2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNRKQ9NRH2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNRKQ9NRH2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNRKQ9NRH2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNRKQ9NRH2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNRKQ9NRH2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNRKQ9NRH2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNRKQ9NRH2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNRKQ9NRH2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNRKQ9NRH2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNRKQ9NRH2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNRKQ9NRH2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNRKQ9NRH2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNRKQ9NRH2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNRKQ9NRH2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNRKQ9NRH2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNRKQ9NRH2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNRKQ9NRH2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNRKQ9NRH2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNRKQ9NRH2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNRKQ9NRH2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNRKQ9NRH2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNRKQ9NRH2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNRKQ9NRH2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNRKQ9NRH2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNRKQ9NRH2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNRKQ9NRH2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNRKQ9NRH2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNRKQ9NRH2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNRKQ9NRH2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SNRKQ9NRH2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNRKQ9NRH2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNRKQ9NRH2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNRKQ9NRH2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNRKQ9NRH2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNRKQ9NRH2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNRKQ9NRH2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNRKQ9NRH2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNRKQ9NRH2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNRKQ9NRH2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNRKQ9NRH2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNRKQ9NRH2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SNRKQ9NRH2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNRKQ9NRH2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNRKQ9NRH2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNRKQ9NRH2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNRKQ9NRH2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNRKQ9NRH2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNRKQ9NRH2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNRKQ9NRH2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNRKQ9NRH2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNRKQ9NRH2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNRKQ9NRH2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNRKQ9NRH2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNRKQ9NRH2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SNRKQ9NRH2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNRKQ9NRH2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNRKQ9NRH2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNRKQ9NRH2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNRKQ9NRH2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNRKQ9NRH2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNRKQ9NRH2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNRKQ9NRH2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNRKQ9NRH2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNRKQ9NRH2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNRKQ9NRH2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNRKQ9NRH2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNRKQ9NRH2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNRKQ9NRH2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNRKQ9NRH2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNRKQ9NRH2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNRKQ9NRH2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNRKQ9NRH2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNRKQ9NRH2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNRKQ9NRH2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNRKQ9NRH2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNRKQ9NRH2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNRKQ9NRH2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNRKQ9NRH2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SNRKQ9NRH2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNRKQ9NRH2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SNRKQ9NRH2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNRKQ9NRH2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNRKQ9NRH2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNRKQ9NRH2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNRKQ9NRH2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNRKQ9NRH2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNRKQ9NRH2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNRKQ9NRH2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNRKQ9NRH2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNRKQ9NRH2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SNRKQ9NRH2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNRKQ9NRH2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms