Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRDM8Q9NQV8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRDM8Q9NQV8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRDM8Q9NQV8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRDM8Q9NQV8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRDM8Q9NQV8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRDM8Q9NQV8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRDM8Q9NQV8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRDM8Q9NQV8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRDM8Q9NQV8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRDM8Q9NQV8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRDM8Q9NQV8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRDM8Q9NQV8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRDM8Q9NQV8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRDM8Q9NQV8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRDM8Q9NQV8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRDM8Q9NQV8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRDM8Q9NQV8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRDM8Q9NQV8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRDM8Q9NQV8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRDM8Q9NQV8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRDM8Q9NQV8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRDM8Q9NQV8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRDM8Q9NQV8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRDM8Q9NQV8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRDM8Q9NQV8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRDM8Q9NQV8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRDM8Q9NQV8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRDM8Q9NQV8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRDM8Q9NQV8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRDM8Q9NQV8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRDM8Q9NQV8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms