Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQL2

RRAGD, Ras-related GTP-binding protein D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGDQ9NQL2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRAGDQ9NQL2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRAGDQ9NQL2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRAGDQ9NQL2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRAGDQ9NQL2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RRAGDQ9NQL2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRAGDQ9NQL2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRAGDQ9NQL2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRAGDQ9NQL2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRAGDQ9NQL2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRAGDQ9NQL2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRAGDQ9NQL2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRAGDQ9NQL2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRAGDQ9NQL2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRAGDQ9NQL2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRAGDQ9NQL2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRAGDQ9NQL2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRAGDQ9NQL2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRAGDQ9NQL2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRAGDQ9NQL2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRAGDQ9NQL2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRAGDQ9NQL2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRAGDQ9NQL2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRAGDQ9NQL2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRAGDQ9NQL2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRAGDQ9NQL2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRAGDQ9NQL2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRAGDQ9NQL2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRAGDQ9NQL2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRAGDQ9NQL2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRAGDQ9NQL2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRAGDQ9NQL2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRAGDQ9NQL2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRAGDQ9NQL2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRAGDQ9NQL2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRAGDQ9NQL2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRAGDQ9NQL2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRAGDQ9NQL2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRAGDQ9NQL2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRAGDQ9NQL2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RRAGDQ9NQL2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRAGDQ9NQL2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRAGDQ9NQL2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRAGDQ9NQL2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RRAGDQ9NQL2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RRAGDQ9NQL2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RRAGDQ9NQL2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RRAGDQ9NQL2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RRAGDQ9NQL2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RRAGDQ9NQL2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RRAGDQ9NQL2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RRAGDQ9NQL2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms