Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG4

PCDH12, Protocadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH12Q9NPG4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms