Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.31■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLMPQ9H6B4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms