Protein–RNA interactions for Protein: Q9H322

VCX2, Variable charge X-linked protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCX2Q9H322 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VCX2Q9H322 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VCX2Q9H322 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms