Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MTMR12Q9C0I1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTMR12Q9C0I1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTMR12Q9C0I1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTMR12Q9C0I1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTMR12Q9C0I1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTMR12Q9C0I1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTMR12Q9C0I1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTMR12Q9C0I1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTMR12Q9C0I1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTMR12Q9C0I1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTMR12Q9C0I1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTMR12Q9C0I1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTMR12Q9C0I1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTMR12Q9C0I1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTMR12Q9C0I1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTMR12Q9C0I1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTMR12Q9C0I1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTMR12Q9C0I1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTMR12Q9C0I1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTMR12Q9C0I1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTMR12Q9C0I1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTMR12Q9C0I1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MTMR12Q9C0I1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTMR12Q9C0I1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTMR12Q9C0I1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTMR12Q9C0I1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTMR12Q9C0I1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTMR12Q9C0I1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTMR12Q9C0I1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTMR12Q9C0I1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTMR12Q9C0I1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTMR12Q9C0I1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTMR12Q9C0I1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTMR12Q9C0I1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTMR12Q9C0I1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTMR12Q9C0I1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTMR12Q9C0I1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTMR12Q9C0I1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTMR12Q9C0I1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTMR12Q9C0I1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTMR12Q9C0I1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTMR12Q9C0I1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTMR12Q9C0I1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTMR12Q9C0I1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MTMR12Q9C0I1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTMR12Q9C0I1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTMR12Q9C0I1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTMR12Q9C0I1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTMR12Q9C0I1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms