Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CIPCQ9C0C6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CIPCQ9C0C6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms