Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRCC1Q9C099 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRCC1Q9C099 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms