Protein–RNA interactions for Protein: Q9C026

TRIM9, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM9, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM9Q9C026 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM9Q9C026 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms