Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZB8

CPEB1, Cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB1Q9BZB8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPEB1Q9BZB8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms