Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC94Q9BW85 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms