Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KATNB1Q9BVA0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms