Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBB6Q9BUF5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms