Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RTKNQ9BST9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RTKNQ9BST9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms