Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3GL2Q99962 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3GL2Q99962 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3GL2Q99962 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3GL2Q99962 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3GL2Q99962 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3GL2Q99962 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3GL2Q99962 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3GL2Q99962 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3GL2Q99962 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3GL2Q99962 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3GL2Q99962 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3GL2Q99962 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3GL2Q99962 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3GL2Q99962 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3GL2Q99962 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3GL2Q99962 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3GL2Q99962 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3GL2Q99962 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3GL2Q99962 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3GL2Q99962 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3GL2Q99962 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3GL2Q99962 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3GL2Q99962 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3GL2Q99962 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3GL2Q99962 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3GL2Q99962 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3GL2Q99962 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3GL2Q99962 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3GL2Q99962 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3GL2Q99962 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3GL2Q99962 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3GL2Q99962 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3GL2Q99962 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3GL2Q99962 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3GL2Q99962 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3GL2Q99962 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3GL2Q99962 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3GL2Q99962 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3GL2Q99962 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3GL2Q99962 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3GL2Q99962 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3GL2Q99962 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3GL2Q99962 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3GL2Q99962 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3GL2Q99962 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3GL2Q99962 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SH3GL2Q99962 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms