Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT3

PRICKLE1, Prickle-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE1Q96MT3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRICKLE1Q96MT3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms