Protein–RNA interactions for Protein: Q96L94

SNX22, Sorting nexin-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX22Q96L94 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX22Q96L94 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms