Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms