Protein–RNA interactions for Protein: Q96F07

CYFIP2, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP2Q96F07 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYFIP2Q96F07 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CYFIP2Q96F07 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CYFIP2Q96F07 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CYFIP2Q96F07 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYFIP2Q96F07 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYFIP2Q96F07 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYFIP2Q96F07 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CYFIP2Q96F07 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYFIP2Q96F07 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYFIP2Q96F07 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYFIP2Q96F07 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYFIP2Q96F07 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CYFIP2Q96F07 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYFIP2Q96F07 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYFIP2Q96F07 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYFIP2Q96F07 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYFIP2Q96F07 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYFIP2Q96F07 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYFIP2Q96F07 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYFIP2Q96F07 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYFIP2Q96F07 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CYFIP2Q96F07 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYFIP2Q96F07 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYFIP2Q96F07 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYFIP2Q96F07 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYFIP2Q96F07 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYFIP2Q96F07 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms