Protein–RNA interactions for Protein: Q96E11

MRRF, Ribosome-recycling factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRRFQ96E11 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRRFQ96E11 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRRFQ96E11 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRRFQ96E11 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRRFQ96E11 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRRFQ96E11 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRRFQ96E11 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRRFQ96E11 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRRFQ96E11 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRRFQ96E11 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRRFQ96E11 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRRFQ96E11 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MRRFQ96E11 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRRFQ96E11 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRRFQ96E11 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRRFQ96E11 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRRFQ96E11 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRRFQ96E11 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRRFQ96E11 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MRRFQ96E11 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms