Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM44Q96DX7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM44Q96DX7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM44Q96DX7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM44Q96DX7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM44Q96DX7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM44Q96DX7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM44Q96DX7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM44Q96DX7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM44Q96DX7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM44Q96DX7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM44Q96DX7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM44Q96DX7 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM44Q96DX7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM44Q96DX7 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM44Q96DX7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM44Q96DX7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM44Q96DX7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM44Q96DX7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM44Q96DX7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM44Q96DX7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM44Q96DX7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM44Q96DX7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM44Q96DX7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM44Q96DX7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM44Q96DX7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.56
TRIM44Q96DX7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM44Q96DX7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms