Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RNF183Q96D59 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF183Q96D59 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms