Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY4

TTC28, Tetratricopeptide repeat protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 2,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28Q96AY4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC28Q96AY4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC28Q96AY4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms